Wyszukaj
PL
EN

Pracownicy

WYKSZTAŁCENIE I STOPNIE NAUKOWE

2013  doktor nauk rolniczych (wyróżnienie); specjalność: genetyka i hodowla roślin, KGHiN URK
2009-2010 Studium Pedagogiczne dla Absolwentów Szkół Wyższych, Centrum Pedagogiki i Psychologii, Politechnika Krakowska im. Tadeusza Kościuszki
2007-2011 Studia Doktoranckie w Katedrze Genetyki, Hodowli i Nasiennictwa Uniwersytetu Rolniczego im. Hugona Kołłątaja w Krakowie (KGHiN URK)
2007 magister inż. biotechnologii stosowanej; specjalność: biotechnologia roślin, MSB ARK 
2002-2007 Studia Wyższe w Międzywydziałowym Studium Biotechnologii Akademii Rolniczej (obecnie Uniwersytet Rolniczy) im. Hugona Kołłątaja w Krakowie (MSB ARK)

PRZEBIEG PRACY ZAWODOWEJ

2015-2016 DAAD post-doc w Max Planck Institute for Plant Breeding Research (Kolonia, Niemcy)
od 2014 adiunkt w Instytucie Fizjologii Roślin Polskiej Akademii Nauk w Krakowie (IFR PAN)

TEMATYKA BADAWCZA

Identyfikacja czynników epigenetycznych determinujących podłoże procesu androgenezy u roślin użytkowych.
Organizacja roślinnego genomu jądrowego na poziomie chromosomowym.
Mechanizmy naprawy DNA u roślin.

PRAKTYCZNE UMIEJĘTNOŚCI

Cytogenetyka/cytogenetyka molekularna: 

Preparatyka chromosomów mitotycznych i mejotycznych. Izolowanie jąder komórkowych.
Znakowanie sond molekularnych.
Fluorescencyjna hybrydyzacja in situ (FISH). 
Genomowa hybrydyzacja in situ (GISH).
Immunolokalizacja zmetylowanego DNA (5mC) oraz zmodyfikowanych form białek histonowych.
Akwizycja i składanie obrazów mikroskopowych.
Pomiary chromosomów, konstrukcja kariogramów i idiogramów.
Cytometria przepływowa (FACs).

Biologia molekularna/bioinformatyka: 

Izolacja plazmidowego i genomowego DNA, izolacja RNA, ligacja, transformacja z wykorzystaniem E.coli, amplifikacja DNA (PCR), RT-PCR, RT-qPCR, genotypowanie, techniki elektroforetyczne.

Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) w tym RNA-seq, obsługa programów do analizy sekwencji oraz biologicznych bazy danych. 

Kultury in vitro:

Zakładanie i prowadzenie kultur in vitro. 
Transformacja materiału roślinnego przy wykorzystaniu Agrobacterium tumefaciens i Agrobacterium rhizogenes.

PUBLIKACJE do 2014

Macko-Podgorni A., Nowicka A., Grzebelus E., Simon P.W., Grzebelus D. 2013. DcSto: carrot Stowaway-like elements are abundant, diverse, and polymorphic. Genetica, 141:255-267. doi 10.1007/s10709-013-9725-6.


Nowicka A., Grzebelus E., Grzebelus D. 2012. Fluorescent in situ hybridization with arbitrarily amplified DNA fragments differentiates carrot (Daucus carota L.) chromosomes. Genome, 55: 1-9. Strona wydawcy.


Czernicka M., Nowicka A., Klein M., Muras P., Grzebelus E. 2011. A cytogenetic approach for the evaluation of hybryd state in Rhododendrons. American Rhododendron Society, 6(1): 10-13. 


​Czernicka M., Nowicka A., Klein M., Muras P., Grzebelus E. 2010. Paternity determination of interspecific rhododendron hybrids by genomic in situ hybridization (GISH). Genome, 53: 277-284. Strona wydawcy.

 

Publikacje według cytowań wraz z indeksami dostępne na portalach:

       

Publikacje

Nowicka A., Kovacik M., Maksylewicz A., Kopeć P., Dubas E., Krzewska M., Springer A., Hoffie R.E., Daghma D.S., Milec Z., Pecinka A., Kumlehn J., Żur I.

The transcriptional landscape of the developmental switch from regular pollen maturation towards microspore-derived plant regeneration in barley

The Crop Journal, 12: 1064-1080 2024

Więcej
Kovacik M., Nowicka A., Zwyrtková J., Strejčková B., Vardanega I., Esteban E., Pasha A., Kaduchová K., Krautsova M., Červenková M., Šafář J., Provart N.J., Simon R., Pecinka

The transcriptome landscape of developing barley seeds

The Plant Cell, 36: 2512–2530 2024

Więcej
Nowicka A., Ferkova L., Said M., Kovacik M., Zwyrtková J., Baroux C., Pecinka A.

Non-Rabl chromosome organization in endoreduplicated nuclei of barley embryo and endosperm tissues

Journal of Experimental Botany, 74: 2527–2541 2023

Więcej
Juzoń-Sikora K., Nowicka A., Plačková L., Doležal K., Żur I.

Hormonal homeostasis associated with effective induction of triticale microspore embryogenesis

Plant Cell, Tissue and Organ Culture, 152: 583–604 2023

Więcej
Dubas E., Żur I., Moravčiková J., Fodor J., Krzewska M., Surówka E., Nowicka A., Gerši Z.

Proteins, small peptides and other signaling molecules identified as inconspicuous but possibly important players in microspores reprogramming toward embryogenesis

Frontiers in Sustainable Food Systems, 5: 745865 2021

Więcej
Nowicka A., Sahu P.P, Kovacik M., Weigt D., Tokarz B., Krugman T., Pecinka A.

Endopolyploidy variation in wild barley seeds across environmental gradients in Israel

Genes, 12: 711 2021

Więcej
Makowski W., Królicka A., Nowicka A., Zwyrtková J., Tokarz B., Pecinka A., Banasiuk R., Tokarz K.

Transformed tissue of Dionaea muscipula J. Ellis as a source of biologically active phenolic compounds with bactericidal properties

Applied Microbiology and Biotechnology, 105: 1215–1226 2021

Więcej
Nowicka A., Kovacik M., Tokarz B., Vrána J., Zhang Y., Weigt D., Doležel J., Pecinka A.

Dynamics of endoreduplication in developing barley seeds

Journal of Experimental Botany, 72: 268–282 2021

Więcej
Zieliński K., Dubas E., Gerši Z., Krzewska M., Springer A., Nowicka A., Matušíková I., Żur I., Sakuda S., Moravčíková J.

β-1,3-glucanases and chitinases participate in the stress-related defence mechanisms that are possibly connected with modulation of arabinogalactan proteins (AGP) required for the androgenesis initiation in rye (Secale cereale L.)

Plant Science, 302: 110700 2021

Więcej
Kovacik M., Nowicka A., Pecinka A

Isolation of high purity tissues from developing barley seeds.

Journal of Visualized Experiments, 164: e61681 2020

Więcej
Nowicka A., Tokarz B., Zwyrtková J., Dvořák-Tomaštíková E., Procházková K., Ercan U., Finke A., Poppenberger B., Otmar M., Niezgodzki I., Krečmerová M., Schubert I., Pecinka A.

Comparative analysis of epigenetic inhibitors reveals different degrees of interference with transcriptional gene silencing and induction of DNA damage

The Plant Journal, 102: 68-84 2020

Więcej
Díaz M., Pečinková P., Nowicka A., Baroux C., Sakamoto T., Gandha P.Y., Jeřábková H., Matsunaga S., Grossniklaus U., Pecinka A.

The SMC5/6 Complex Subunit NSE4A Is Involved in DNA Damage Repair and Seed Development

The Plant Cell, 31: 1579–159 2019

Więcej
Nowicka A., Śliwińska E., Grzebelus D., Barański R., Simon P. W. , Nothnagele T., Grzebelus E.

Nuclear DNA content variation within the genus Daucus (Apiaceae) determined by flow cytometry

Scientia Horticulturae, 209: 132-138 2016

Więcej
Nowicka A., Grzebelus E., Grzebelus D.

Precise karyotyping of carrot mitotic chromosomes using multicolour-FISH with repetitive DNA

Biologia Plantarum, 60: 25-36 2016

Więcej

Projekty